Начнем сначала)
Запустили PyCharm

Для любителей русскоязычного интерфейса, к сожалению, нужно пройти много кругов установок разных плагинов), поэтому оставляйте английский. Как говорит мой хороший друг при игре в FIFA: Ну хватит уже переделывать под себя управление, играй как все). Так что играем, как все) Привыкайте к англоязычному интерфейсу.
Если вы запустили впервые на компьютере PyCharm, то программа будет иметь вид, как на скриншоте выше.
Сначала расскажу, как создать и настроить первый проект, если просто нужно решить математическую задачу. Далее будет подробная инструкция, как создать проект правильно для серьезных задач (с файлами, библиотеками и так далее)
Первый проект в PyCharm
Выбираем New Project

Ничего не меняете - просто нажимаете Create внизу справа
Ждете загрузку всех параметров и так далее.
Будет такое окно

Нажимаете на саму папку проекта - будет выделено синим цветом.

далее на плюсик выше папки

И нажимаем на New File or Directory
Очень рекомендую постепенно запоминать горячие клавиши. Удобно со временем будет пользоваться ими, как настоящие хацкеры.
Появится выбор

Естественно файл Python
Придумайте имя файлу. Английскими буквами)

Можно писать код и запускать)

Запускается код нажатием на зелёный треугольник рядом с Current File
Удобно использовать подсказки. Нажатием на клавишу Tab заполняется автоматически. Но, если вы только начинаете свой путь в программировании, то подсказки можно отключить. Ниже покажу, как это сделать.
Запускаем код.
В нижней части окна программы автоматически откроется терминал и будет выведен результат.

Отключаем подсказки (автозаполнение) в PyCharm
File - Settings

Далее пройти по пути, который на скриншоте и убрать галочку Enable automating comletion on typing

Если хотите вообще убрать подсказки полностью, то уберите эту галочку Show suggestions as you type

Но, последнее делать не рекомендую, лучше привыкнуть к стандартным подсказкам и пользоваться ими) Экономия времени 100%
На данный момент умеем запустить PyCharm, создать файл, написать код и запустить код)
Но, могут возникнуть моменты, когда нужно сохранить файл отдельно и его хочется найти быстро. Работать с файлами текстовыми или картинками. Все это удобно делать в папке, которую вы заранее создали где-то в удобном для вас месте.
Пример правильного создания проекта в PyCharm
Главная суть конкретно этого гайда в том, что я не сторонник всё делать в одном программном обеспечении, поэтому выношу сам проект отдельно, а PyCharm, к примеру, просто инструмент, при помощи которого с проектом работаю.
Создаем папку в удобном для вас месте.

Я для примера использую путь, как на скриншоте.
Теперь при открытии PyCharm заново после закрытия у вас будет всегда вылазить последний проект. Но, иногда, это неудобно.
Нажимаете на четыре полоски в верхнем левом углу.

Откроется меню)
Выбираем Open

Находите вашу созданную папку, выбираете её и нажимаем открыть.
Появится такое окно.

Лучше нажимайте по умолчанию The Window
Так как компьютеры зачастую, особенно в школах не сильно позволяют открыть много проектов сразу)
В случае такого сообщения

Нажимаем Trust Project
Ждем настройку конфигурации

Пишем код и запускаем

Далее рассмотрим создание конфигураций к дополнительно созданным файлам.
Когда это нужно?
К примеру, вам удобно разные задачи решать в разных файлах, ну бзик такой вот), значит смело создаем файл, пусть будет ex2.py
Пишем какой то код, запускаем его и ....

Опять запустился код в в файлике main
Почему так произошло?
Потому что в данном случае создана конфигурация под файлик main
Исправим ситуацию
Создание своей конфигурации запуска файлов в PyCharm
Нажимаем на main
Выбираем Edit Configurations

Откроется такое окно

Изменяем название
и путь до нужного файла

нажимаем ок)
Запускаем новую измененную конфигурацию

Как видим, уже напечаталось))
Естественно, вам будет неудобно постоянно редактировать конфигурацию, поэтому мы будем их добавлять
Если снова зайти в настройки конфигурации, в левом верхнем углу вы увидите плюсик, нажмите на него.

Откроется окно создания новой конфигурации
Естественно Python

Всё заполняем по шаблону старой конфигурации

Я сделал такой пример

Естественно, путь к файлу не прописывайте вручную)), там можно выбрать в режиме выбора файла) (папочка справа от строки)
Нажимаете Ок
Теперь у нас есть две конфигурации на выбор)

Выбираем нужную и запускаем.
Далее открыть, как открыть файл, покажу на примере текстового файлика, пусть будет некий очень слабый пример ЕГЭ по информатике 17 задание)
Работа с файлами в PyCharm
Для начала договоримся, что вы можете файл создать или скачать, но всегда его закидываете в папку проекта

Файлик перед использованием в PyCharm сохранить и закрыть.
В самом PyCharm файл сразу же отображается и его также можно просто открыть для просмотра. Заранее предупреждаю, если вы решаете ЕГЭ (учитесь) , то не открывайте файлы 26 и 27 заданий) ну или попробуйте пару раз, для осознания глубины глубин)

Пишем код и запускаем

Всё работает, тренируемся)
В дополнение
Если эта надпись немного нервирует, то в дальнейших материалах будет объяснение, как избавиться)

Успехов!